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        聯想辦公電腦HPC的發展為生命科學研究突破瓶頸

        文章出處:正方康特聯想商務電腦總代理人氣:-發表時間:2016-11-07 11:03:00【
        摘要 : 中國醫療行業突飛猛進,需要更多的民營企業家,給跟多的支持,讓中國的民族品牌越來越多,發展越來越強勝。小編(北京正方康特)帶領大家看一下中國品牌聯想是如何做到的。

        中國醫療行業突飛猛進,需要更多的民營企業家,給跟多的支持,讓中國的民族品牌越來越多,發展越來越強勝。聯想辦公電腦代理商(北京正方康特)帶領大家看一下中國品牌聯想是如何做到的。


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        提到基因測序,大家可能會想到高精尖的科研院所,但這跟普通人有什么關系嗎?事實是,關系真的很大!由于基因記錄和控制著遺傳信息的表現,基于基因層面的“精準醫療”,能夠幫助治療各種先天性疾病、腫瘤癌癥等。


        高端醫療


        近日,更是傳來令人振奮消息,第三代基因測序儀研發取得階段性成果。相比二代,其價格下降了10倍,速度提升了10倍,并且能在幾個小時內生成報告。對于普通人來說,以后只需要花費幾百元,就可以享受消費級基因數據解讀與個性化的健康服務了。


        人體基因


        『 成果可喜;技術挑戰依然任重道遠 』

        雖然,基因測序技術的研究成果可喜。但是,依然面臨著計算量大、極端耗時,需要超高速和超大內存的超級計算集群以及組裝質量可靠性低、測序錯誤率高等技術挑戰。

        如何攻克這三大難題,大幅度提高三代技術的市場競爭力,讓基因測序惠及更多人,成為眾多廠商、科研人員及從業者關心的問題。


        2


        7月1日,以“開啟E級計算新篇章”為主題的2016聯想全球超算峰會,在北京隆重召開。在教育、科研、醫療行業分會場,來自清華大學醫學院高性能計算中心、北京諾禾致源生物信息科技、藥明康德新藥開發等公司和Mellanox的專家就基因行業HPC(高性能計算)應用話題進行深入的交流和探討。

        『 基因測序的突破;離不開HPC 』

        從基因測序中的蛋白質分析,到醫學轉化的精準醫療,都離不開高性能計算和大數據分析。在基因序列測序過程中,首先需要用電鏡自動采集和實時存儲基因蛋白質分子的圖像,然后使用計算機對圖像進行預處理和設置操作,進行2D和3D重構,并輸出結果。

        而基因測序的醫學轉化,則需要利用高通量測序平臺對人類不同個體或群體進行全基因組測序,并在個體或群體水平上進行生物信息分析。全面挖掘DNA水平的遺傳變異,為篩選疾病的致病及易感基因, 研究發病遺傳機制和預防治療方案提供重要信息。


        DNA


        在蛋白科學研究和發展中出現了兩大技術革命,一個是直接電子探測器的發明,它的出現讓數據采集規模提升了100倍。同時,在電鏡圖形質量上有了質的飛躍,并且在速度上大幅提高,還可以以電影的形式快速記錄電鏡圖像。有了快速電影記錄,研究人員就可以追蹤圖像漂移軌跡而對圖像做運動矯正和輻射損傷矯正,大大提高數據質量。

        另一大技術革命就是高分辨率圖像處理算法的改進,它能夠進行大規模的并行計算,并且擁有極高的精度、準度和收斂性。然而,這兩大技術革命在為蛋白質科學研究帶來跨越式進步的同時,也帶來了數據處理和計算規模的臨界點。


        醫療數據報告


        HPC的發展為生命科學研究突破瓶頸,提供了強有力的支撐。以采用了聯想System x3950 X6八路服務器解決方案的清華大學醫學院高性能計算中心為例,單臺服務器采用8顆Intel至強E7 CPU,內存可按需靈活擴展。同時,采用聯想獨有的內存加速技術,從4路到8路,性能提升1.6倍-1.7倍。數十項RAS高可靠性,有效保障數據安全。

        『 軟硬結合;聯想HPC可靠承載重托 』

        聯想新一代智能超算集群管理軟件LiCO,可為HPC用戶提供簡便的集群訪問權,實現以更低的軟件和管理成本使用HPC。此外,其“開放性”的架構使開發人員或使用用戶,不僅可以根據自身需求對組件進行定制選擇,還可以通過開放的軟件接口進行二次開發,具有很強的可擴展性。在計算任務運行時間緊迫,分秒必爭的情況下,實現高效計算,提高單位時間的計算任務吞吐量,并保證大規模計算任務的穩定調度和運行。

        文章推薦:聯想為基因層面的“精準醫療”提供完善解決方案

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        除了計算與管理,指數級的數據增長帶來的數據存儲與管理挑戰、數據存儲要求不同帶來的異構存儲管理挑戰,同樣十分嚴峻。清華大學醫學院高性能計算中心采用的是FEI TITAN KRIOS 300千伏透射電鏡,4臺Titan電鏡手工模式下,每天的存儲容量約為28TB,每年的存儲容量約為10.2PB,三年累計數據超過30PB。聯想大容量分布式存儲池,可為大規模的測序數據進行量身定制,實現注釋、過濾和可視化的數據展現,同時非常好地實現數據的共享和隔離。


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        對生命的探索沒有盡頭。未來,基因技術將會帶領行業發展大爆發,帶來無法估量的價值。HPC的發展,能夠讓這些看起來高精尖的技術,更快的應用到我們的生活。

        聯想在不斷的努力為國家各行業付出的,北京正方康特作為京津冀大客戶聯想代理商,我們是驕傲的,同時我們給大客戶提供更完善的服務,聯想商務辦公電腦定制解決方案。

        本文由聯想辦公電腦代理商北京正方康特信息技術有限公司推薦,轉載請注明出處??!正方康特公司目前的主營業務有IT硬件產品的銷售,主要是聯想臺式電腦、聯想筆記本、聯想一體機電腦、聯想服務器、網絡產品、存儲產品、外設等,核心合作產品以聯想品牌為主。咨詢聯想電腦報價有意者可直接撥打電話:010-62559028或加我QQ:1364544170,正方康特隨時歡迎您的光臨!!

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